Miseq操作流程及报价须知

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导读:统统审核只需90分钟。,手工操纵操纵不超越20分钟。,点击触屏开端排序MISEQ装修最简略的新GE,经过用眼的的触屏喉舌赚得简略的家用电器操纵,手工操纵操纵统统聚居地的建立和定序审核,操纵复杂。,抓操纵,总本钱:收集器+建库+抓操纵+定序+唱片评剖析=2421+2000+300,一、最简略快的捷的书目被发展的状态方式Illumina为研究者装修了最简略快的捷的书目被发展的状态方式,应用病症

一、最简略快的捷的书目被发展的状态方式

Illumina为研究者装修了最简略快的捷的书目被发展的状态方式,应用病症umina NExuta转使站立酶技术,DNA零件可在试管中最后阶段。,不喜欢身体的剪下的东西或酶剪辑手续。,逐渐最后阶段DNA零件化,端部整安然平静衔接的手续,统统审核只需90分钟。,手工操纵操纵不超越20分钟。,初始DNA仅强制的50ng。。总体担保的自动化体系,点击触屏开端排序MISEQ装修最简略的新GE。经过用眼的的触屏喉舌赚得简略的家用电器操纵,具有RFID下列的即插即用药剂,自动化获利。精巧、集成的MISEQ平台集成了聚居地建立。,边和边排序与完全的唱片评剖析,不喜欢额定的附带素养。。手工操纵操纵统统聚居地的建立和定序审核。证实的唱片大规模的是鉴于Illumina的已显示出边的分解边的。,经过ReviBL大规模摞合定序数以百万计的零件,当独唱碱基被添加到DNA链时,它们被检测到。。因每个检测送还射中靶子四个一组之物可医治的塞住器射中靶子全部都是CO。,故此,生来竞赛最低消费了登记扭曲。,与以此类推技术相形,大大地压低了原始误码率。。终极出来奢侈地正确的每个碱基的定序数据,即苦反复序列和均聚物抵押权了可信赖的的碱基检测。。

书斋构成:剪下的东西,加参与

二、总体担保的自动化体系,点击触屏开端排序。

Miseq 装修最简略的子孙定序审核。。经过用眼的的触屏喉舌赚得简略的家用电器操纵,即插

习惯于药剂是背着背包徒步旅行的。 RFID 追踪,自动化获利。精巧、使联合的 Miseq 平台集成聚居地建立,边和边排序与完全的唱片评剖析,不喜欢额定的附带素养。。统统聚类建立和定序审核不超越手工操纵 20 分钟。 三、证实唱片大规模的

以 Illumina 显示出边的分解边的排序技术是根底。,经过ReviBL大规模摞合定序数以百万计的零件,DNA夸大的单碱基掺入。 在链工夫检测它们。鉴于在每个检测CyCl中有四个一组之物可医治的塞住子的结成 都在,故此,生来竞赛最低消费了登记扭曲。,与以此类推技术相形,大大地压低了原始误码率。。终极出来奢侈地正确的每个碱基的定序数据,即苦反复序列和均聚物抵押权了可信赖的的碱基检测。。

在附近有区别的的定序大量、有区别的定序战利品的最佳效果定序打算对比地

高通量定序服务业 两代定序服务业 hiseq 放大率子定序 sanger定序

在附近有区别的的定序大量、有区别的定序战利品的最佳效果定序打算对比地

1. 依据检测独唱范本所需的生殖细胞的细胞质地域,有

a. 排序地域 <= 100Kb,推荐用Sanger法定序

b. 500Kb <= 排序地域 < 100Kb,推荐用放大率子法定序

c. 200Kb < 排序地域 <= 100Mb,推荐用目的区域抓定序 2. 依据上面的分法,经济对比地

a. Sanger法定序,适用地域:排序地域大量 <= 100Kb

i. 用习俗sanger法定序,

1. 每500bp测一对来回地,每个序列为20元(PCR)。 + Sanger定序。 2. 每个战利品的排序本钱:100000/500 * 20 = 4000元素/战利品。 3. 唱片评剖析,500元素/战利品

4. 再多打扰有一点儿。,总费用4500元/战利品。。优势选择。

二。 高通量定序,唱片库2000元素/战利品,附加排序本钱1000~3000元/战利品。,有两代人的勘探。

强制的的生物数据剖析费,本钱做错独一优势。。高通量定序是这边最适当的的优势。,在试管中最后阶段PCR是能够的。,增加初始范本尺寸(DNA)的应用。

b. 放大率子 + 二盐基的定序,适用地域:500Kb <= 排序地域大量 < 100Kb

i. 放大率定序(放大率子)法 1. 以200Kb,100范本为例

2. 底漆与PCR,多功能的PCR底漆的设计,每个放大率子的大量约为150 bp。,合计120000元,使成比例到

每个战利品,1200元

3. PCR回应经文,本钱 20元素/战利品 4. 建库,2000元素/战利品 5. 定序,

a. Miseq平台,5G唱片/运转,26500元/润

b. 假定每回运转一次,24个战利品停止了勘探。,每个战利品的定序教派的本钱。:26500/24=1104

元素/战利品

c. 假定独一范本超越24个,定序的本钱可以进一步地使成比例。 6. 唱片评剖析, 500元素/战利品

7. 总本钱: 1200 + 20 + 2000 + 1104 + 500 = 4824元 二。 唱片部分相同吃水: 1. Miseq平台,

a. PE 2*250 定序形式

b. 总5G唱片/淹没池,

c. 分为24范本。,多达96个战利品。 d. 被测地域, 200Kb

e. 部分相同吃水,5,000,000,000/24/200,000 = 1041倍部分相同率;假定有96个范本,

5,000,000,000/96/200,000 = 260倍

2. PGM平台

a. 314筹码(或316/318筹码),仅仅通量不同,无大规模的不同)

b. 分为4个范本。

c. 每个314筹码的唱片输入为0.1g。 d. 测地域200 KB

e. 部分相同吃水,100,000,000/4/200,000=125倍

i二。 放大率定序是100kb~500 kb定序射中靶子次要选择

IV。 Sanger法定序,200000 / 500 * 2 *30=24000,本钱过高,不可加工的 v. 抓定序,约5000~6000元,较贵,操纵复杂。,剖析同样复杂的。,

vi. 放大率子定序的限度局限混乱:在定序前,多功能的序列应该是多功能的PCR。,到眼前为止,多功能的PCR放大率性能的齐性一直是。更多的放大率子,异质性越高。。用于定序超越500 kb。,应用放大率子定序法是拮据的。。

c. 目的区域抓法定序,适用地域:100Kb < 排序地域 <= 100Mb

i. 抓法定序 1. 购买抓配套元件,

a. Nimblegen的SeqCap EZ Choice Library, 96 Reaction,USD30000 b. 相当于每人的回应经文价钱25%的税:30000×*元/回应经文 2. 建库,抓回应经文

a. 建库, 2000元素/战利品

b. 抓操纵, 3000元素/战利品

3. 定序,Hiseq 2500 Rapid PE150定序(临床范本追踪进度),Rapid快,仅2天定序,比

Hiseq 2000 high throughput PE100 11天更正常的), a. 每个淹没池, 75G PF data b. 每个战利品每回2g。 PF data

c. 淹没池,24范本,因范本中间在定序审核射中靶子交互竞赛,因而标本每个战利品。

3G战利品,这抵押权了质量范本可以获得2G关于的唱片。。24*3=72G

d. 定序吃水,假定抓空间为7m,抓性能为65%(适合异性为35%)。,

2,000,000,000 * 0.65 / 7,000,000 = 185倍,清偿过的绝质量勘探必要条件 e. 排序本钱,每个Hiseq 2500 rapid PE100 flowcell,8万元,使成比例到24范本,80000/24=3333

元素/战利品

4. 唱片评剖析

a. 假定:2000元素/战利品 5. 总本钱

a. 总本钱:收集器 + 建库 + 抓操纵 + 定序 + 唱片评剖析 = 2421 + 2000 + 3000 + 3333 +

2000 = 12754元素/战利品 二。 抓定序优势选择

i二。 放大率子定序,因多功能的PCR射中靶子多功能的数强制的其序列,因而这是不可加工的的。。MISEQ或PGM的唱片输入不克不及地租地部分相同勘探战利品。。

3. 破费工夫的对比地

a. sanger法,中频同一时刻,在10kb的地域内,可在1~2天内最后阶段。

b. 放大率子法,凑合酶链回应经文天数,结构2~3天,定序1~2天,唱片评剖析2~3天,快的的1周产物 c. 抓法,结构2~3天,抓2~3天(私生子),必然的是舒缓的,不愉快,定序2~3天,唱片评分

2~10天剖析,快的10天产物

五星级书目组编最终研究报告。、专业文学、试场材料、文档下载、党组任务、名胜、使产生效果文档、外文竞争与Miseq操纵工序及报价须知等实质。

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